Il Museo Archeologico "Alle Clarisse" ha ottenuto da parte della Regione Autonoma della Sardegna il riconoscimento regionale, al quale si collega l'istituzione dell'Albo regionale degli istituti e dei luoghi della cultura che mira a consolidare il principio della qualità, promuovendo il Sistema museale della Sardegna.
Con determinazione N. 1842 del 29/12/2015 prot. n 20458 della Regione Autonoma della Sardegna, il Museo Archeologico "Alle Clarisse" ha ottenuto il riconoscimento effettivo, in quanto in possesso di tutti i requisiti di qualità, ai sensi della Legge Regionale 20/09/2006 n. 14 "Norme in materia di beni culturali, istituti e luoghi della cultura" e della D.G.R n. 33/21 del 08/08/2013, annualità 2015.